欧文氏杆菌铁代谢相关基因的生物信息学分析

时间:2022-09-06 03:52:35

欧文氏杆菌铁代谢相关基因的生物信息学分析

摘要:利用生物信息学软件对欧文氏杆菌(Erwinia carotovora subsp. atroseptica)基因

>> 黄瓜DVR基因的生物信息学分析 结核分枝杆菌pst S1基因的扩增及生物信息学分析 丙酮醛诱导细胞凋亡相关基因SHMT2L的生物信息学分析 子宫内膜异位症相关基因和microRNA的挖掘及生物信息学分析 FZ6基因及其蛋白的生物信息学分析 丹参SmNAC1基因的克隆和生物信息学分析 小菜蛾p38MAPK基因的克隆与生物信息学分析 沙棘WRI1转录因子基因的生物信息学分析 水稻2个F―box基因的生物信息学分析 小菜蛾PxALP1基因的克隆与生物信息学分析 太子参分解代谢关键酶8′羟化酶基因的克隆及生物信息学分析 癫痫相关基因SCN1A启动子区多态性位点的生物信息学分析 结核分枝杆菌38kDa蛋白结构与功能的生物信息学分析 玉米淹水诱导表达ZmERF5基因启动子的克隆与生物信息学分析 茶陵野生稻冷响应基因OrCr3的克隆及其生物信息学分析 黄芩葡萄糖醛酸水解酶基因的克隆、生物信息学分析及表达 黔北麻羊RERGL基因cDNA克隆与生物信息学分析 不同物种GATA—2基因编码区生物信息学分析 石榴等观赏植物DFR基因生物信息学分析 高丛越桔UFGT基因电子克隆和生物信息学分析 常见问题解答 当前所在位置:l),包括26种古细菌,286种真细菌。截至2013年9月,收录在GenBank已测基因组全序列的植物病原细菌种类达31种,依靠传统的研究思想和试验手段注释如此庞大的生物信息资源几乎是不可能的。生物信息学的首要任务之一是分析新基因的功能,即从大量不连续的信息中发现其中隐藏着的重要信息。

通过多重序列比对筛选保守序列是生物信息学方法的基础,几乎所有的注释序列的意义、研究序列结构的方法都是建立在此基础上的。保守序列是指病毒在进化过程中基因组序列保持不变或变异很小的序列。在进化过程中,变化很小或者不变的序列往往承担着极其重要的功能,一旦出现变化,功能就会受影响或者被破坏,物种就有被淘汰的危险。因此,保持不变或变化很小的序列可能具有相同的功能。国际上已有专门的数据库(如Blocks、PROSITE和IDENTIFY)和分析软件(如BLAST、DNAsis、FASTA、GCG、MOST、Emotif和Tool)用于保守序列的分析。

本研究利用生物信息学方法对欧文氏杆菌基因组进行分析,发现了71个与铁代谢相关的基因,分别参与了欧文氏杆菌中铁载体的生物合成以及铁的运输、吸收、贮存和调控。

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