Secis结构及相关因子控制硒蛋白合成的综述

时间:2022-08-05 02:54:07

Secis结构及相关因子控制硒蛋白合成的综述

摘要: 硒是一种重要的微量元素,对人体健康具有重大意义,与癌症、神经方面的疾病等密切相关。它大多以硒代半胱氨酸sec的形式存在于硒蛋白中,被称为第21种氨基酸。目前研究表明硒代半胱氨酸在UGA处的插入需要secis结构、secis结合蛋白SBP2、延长因子EFSec等的共同作用,对UGA密码子进行重编码。许多含有sec的蛋白都是催化氧化还原反应的酶,如谷胱甘肽过氧化物酶、碘化钾腺氨酸5′-脱碘酶、琉氧还蛋白还原酶等。该综述讨论secis结构特征及其作用的关键部位、secis与各种控制因子的相互作用,并列出已经发现的secis结构的发现手段。

关键词: 硒蛋白;SBP2;Secis

中图分类号:R917.7文献标识码:A文章编号:1671-7597(2012)0320013-01

真核生物中硒代半胱氨酸的表达需要蛋白因子如延长因子EFSec、secis连接蛋白2(SBP2)以及一种顺式mRNA结构――硒代半胱氨酸插入序列(secis)。它们协同发挥作用。除此以外,UGA密码子重编码的效率还受到硒蛋白mRNA中其它顺式作用元件的调节,如硒代半胱氨酸密码子所处的位置、UGA与secis结构间的距离、与UGA毗邻的颈环结构的出现等。

1 Secis结构

Secis结构是由60个左右的核苷酸组成的RNA序列。它可以在其他因子帮助下将UGA由终止密码转换为编码硒代半胱氨酸的密码子。截止到目前共描述了两种secis结构。他们有几个共同特点:一个开放区域、一个核心还有一个茎一个环。在茎的5′端有AUGAN序列,在茎的3′端有NGAN序列。在核心区域碱基不符合配对原则。Secis核心区的保守序列、颈环结构及基因二级结构的改变都会严重影响secis的功能[1]。

2 Secis结构在细菌和真核生物中的区别

在细菌中,secis结构紧接着出现在编码区UGA密码子之后,它只能作用于一个UGA密码子。它必不可少的的部分包括顺式作用元件、SelB的链接区和颈环结构[2]。硒代半胱氨酸能够在UGA处插入,颈环顶部的SelB停泊位点尤为重要。SelB是细菌中一个特殊的延长因子,它在吸引硒代半胱氨酸的tRNA和调节阅读框在UGA处的通读具重要作用[3]。而Sec-tRNASec的合成需要其他三种因子的作用,它们是SELA、SELC、SELD。

在古生菌和真核细胞中,secis结构出现在mRNA的3' UTR处,位于UGA下游很远处,一般间隔在500到5300个核苷酸之间。所以真核secis结构可以作用于多个UGA密码子。secis结构的颈环处有一反转扭曲结构即kink-turn structure,成为SECIS-binding protein 2(SBP2)的停泊位点,该结构对UGA的重编码有重要作用,也有人猜测该结构是一个分子开关,在有蛋白因子结合时发生构象变化。颈环该处核苷酸的突变将导致secis功能的丧失,表明sbp2是sec插入的关键元件,它可以吸引EFSec元件使之与其相互作用。有研究表明核糖体蛋白L30通过识别secis RNA结构,在硒蛋白的合成过程中也有重要作用,而且SBP2的secis-RNA结合区域中就有一个子域是属于L7Ae/L30家族,而该家族中就包含有核糖体蛋白。同时有研究运用生物序列分析和生物物理手段表明SBP2是Intrinsically Disordered Proteins(IDP)家族的成员。真核生物secis结构在核苷酸水平上并非高度保守,但是其二级结构显示为一致的stem-loopstem-loop 折叠结构。Secis核心区的两个G-A碱基对在所有的真核生物secis结构中都是高度保守的,它们的存在对于secis结构和SBP2、L30两种重要蛋白因子的结合是必须的。对于AAA/G结构,目前我们还不知道它的功能和相互作用关系,在某些secis结构中,这个模式可能会被CCN替代。Secis结构GA碱基对附近区域是高度可变的,它可以影响RNA的Kink-turn区域的折叠,还会影响SBP2、L30两种蛋白因子与secis结构的结合活性。

3 SBP2和EFsec

硒蛋白结合蛋白SBP2是在酵母中发现的,具有846个氨基酸。它是硒代半胱氨酸合成的限制因子。SBP2蛋白因子上有与硒蛋白的mRNA结合的区域,在生物体外和体内的实验均发现SBP2与mRNA结合在一起。有研究表明SBP2在经过一定折叠后,可以与EFsec相互作用,帮助其发挥促进延伸的作用。同时SBP2可能具有避免翻译在UGA处终止的作用。在硒蛋白合成时,延长因子EFSec需要与SBP2共同作用。EFSec与特定的t-RNA形成复合物,作用于UGA密码子使其表达硒代半胱氨酸。研究表明在细菌中,通过SELB因子上的EFSec和secis-RNA连接位点,可以把EFSec和secis都带到核糖体上。EFSec需要与SBP2一起发挥作用。

4 Srcis结构鉴定需要脱碘酶

Secis结构是通过核苷酸序列来定义的。但并非所有的secis结构导致UGA通读后,都有硒代半胱氨酸的插入。Secis结构的确定主要依靠secis可以导致阅读框在UGA终止子处通读的性质,在UGA之后拼接上一段脱碘酶的基因,观察脱碘酶基因的表达情况即可验证。

5 发现secis结构的手段

由于硒蛋白基因的内在特点、阅框内UGA的干扰及其相关联的secis结构的限制,寻找新的硒蛋白比较困难。但是通过软件已经可以成功的寻找secis结构。对已知的secis基因序列进行编辑,可以使用NBLASTP mode in the GeneDB database。

6 结果与讨论

硒蛋白对生物体的健康异常重要。secis结构、SBP2、Efsec等对硒蛋白的表达具有重要作用。但目前对于内源性硒蛋白mRNAs中的secis结构如何调节有机体内硒代半胱氨酸整合进延长肽链的效率,我们了解的不多,需要进一步研究。

参考文献:

[1]Sutija, M.and J.M.Joss,Thyroid hormone deiodinases revisited:

insights from lungfish: a review. J Comp Physiol B 2006;176:87-92.

[2]Mix, H., A.V. Lobanov, and V.N. Gladyshev, SECIS elements in the coding regions of selenoprotein transcripts are functional in higher eukaryotes. Nucleic Acids Res 2007; 35:414-23.

上一篇:发展光伏产业应加速成为国家战略 下一篇:中移动在SOA和云计算融合发展的思考