mtDNA异质性及其法医学应用

时间:2022-06-15 02:57:41

mtDNA异质性及其法医学应用

【关键词】mtdna异质性

【中图分类号】d919.2

【文献标识码】b

【文章编号】1007—9297(20__)02—0140—04

线粒体dna(mitochondrial dna,mtdna)是惟一

的细胞核外dna。人类mtdna为一的环状双链

结构,长16569 bp,由富含嘌呤的重链(h链)和富含

嘧啶的轻链(l链)组成。mtdna编码区的序列相对保

守,其非编码区长1 122 bp,又称为控制区。控制区的

碱基变异相对集中分布在15996~16401nt和29~408

nt两个区段,分别称为hv i和hvli。后来,lutz等【l】

发现在438~574nt间也存在较多的碱基变异,称为

hvⅲ。mtdna呈母系遗传特征,加之其拷贝数多、突

变率高、抗腐败能力强,具有极高的法医学应用价值。

个体发育源于一个受精卵,理论上同一个体所有

的mtdna序列应是一致的。但实际却发现有少数同

一个体的mtdna碱基序列并不完全相同。这种同一

个体mtdna出现两种或两种以上的碱基序列的现象

称为异质性(heteroplasmy)。121其在人体的存在表现为

同一个体不同组织、同一组织不同细胞或同一细胞不

同线粒体之间存在不同的mtdna序列。

、mtdna异质性形成的可能机理

mtdna异质性发生机制至今还不是很清楚

hauswi~h和laipis(1982)在研究牛线粒体dna多态

性时发现异质性线粒体dna在卵母细胞和胚胎早期

发育阶段发生快速分离的现象,从而提出线粒体dna

遗传的瓶颈理论。[31后来人们多用该理论来解释

mtdna异质性的形成原理。

mtdna异质性的本质是突变.即突变型和野生型

mtdna以不同比例共存,其发生与mtdna拷贝数多、

不对称复制及缺乏校正修复机制等密切相关。瓶颈理

论认为:卵母细胞在分化成卵细胞及形成受精卵的过

程中,卵母细胞和受精卵中数千个mtdna子集合群

体(不同序列mtdna混合),似通过瓶颈一样的阻塞

作用而使各个mtdna子集合群体数量明显减少,只

有少数mtdna进行选择性复制,故一种突变基因型

可以占优势并固定出现在下一代中。ashley等[41发现

该“瓶颈理论”结果与人类mtdna相似,即在单个个

体中异质性的大小可以改变,子代可以有不同的基因

型,仅仅两三代异质性就可以转为同质性。

共存的突变型和野生型mtdna通过减数分裂或

有丝分裂随机分布到子代细胞中,由此细胞中突变型

和野生型mtdna比例随之发生随机增减,也称遗传

渐变,最终,再分裂的子代细胞有向全部为突变型或

野生型mtdna。即同质体的方向发展的趋势,该过程

称为“复制分离”。随着复制分离和遗传渐变的发生,

一些mtdna中选择作用不明显的突变建立起同质

体.并以一定的频率保留于人群中.形成mtdna某些

区段的多态性。然而,一些重度突变因复制分离造成

的同质体个体极易因自然选择而淘汰。因而,多数重

度突变无法建立起同质体,表现为异质体,异质体在

人群中往往只能建立较低频度的多态性。

遗传瓶颈出现在卵细胞形成过程中的推测后来

得到了证实。bendall等【5i研究了180对双胞胎,其中

发现4例有异质性。采用遗传渐变理论模式推算,估

计减数分裂的代间瓶颈大约有2至,100个分子.对于

特定的母子间传递的mtdna估计有3~2o个分子

作者计算人mtdna—hvi的突变和固定的率在1.2x

1o ~2.7×10-5/每代、每位点之间,相当于1个转位

突变/2500年至1转位突变/55000年的范围。调查结

果与其他文献报告基本相符,说明遗传瓶颈相对比较

狭窄,形成了一种制约因素。调查结果也证实,不同的

母系间的瓶颈大小确有差异。

一个成年人体内mtdna估计有一兆,mtdna复

制聚合酶缺乏忠实性,受精后的细胞发育过程中出现

变异,形成组织间mtdna型别差异的可能性的确存

在。有研究发现原胚层组织异质性是一致的,胎儿各

组织型别一致,但到了成人,不同组织的异质性分布

【作者简介】翟仙敦(1977一),女,山西临汾人,硕士研究生,助教,主要从事法医遗传学研究。tel:+86—027—83692645;e—mail:san—

mao506@ 163.corn 。

法律与医学杂志20__年第l3卷(第2期)

出现差异。tully等(1998)用dgge方法检测21名成

年人不同组织如血、骨、毛发、肝、肌肉,发现异质性出

现的程度有差异,有的容易检出 有的不能检测。研究

资料显示,在细胞分化、发育过程中,也可有mtdna

控制区碱基变异。实验观察组织问异质性的发生存在

与卵细胞形成过程中类似的瓶颈,ciafaloni等发现同

一个体不同组织变异型与野生型mtdna出现率有差

异,证实了组织问存在异质性的分离。例如某妇女,经

过多次提取口腔拭子和血样,检测出异质性,同个体

头发材料,5根是16355t,3根是16355c,2根是两种

型的混合物。提示在细胞分化、发育过程中也可能存

在另一种瓶颈。

二、mtdna异质性的类型及好发位置

异质性按其存在形式分为点异质性和长度异质

性两类,它既可发生在代问也可发生于代内。正常人

mtdna异质性高发于控制区,而编码区几乎没有。[61

通常,异质性序列之间差异仅限于某一个碱基,称

为点异质性。同时出现两个位置碱基序列不同的概率

虽小,但仍有报道:而同时出现3个或者3个以上的

情况至今尚未见报道。mtdna序列变异主要是复制过

程中碱基错配,其中转换占90%以上。少数是颠换。点

异质性主要集中于hvi和hvii。hvi碱基转换类型

多发生在嘧啶之间,约为80%。hvii的转换碱基中,

嘧啶与嘌呤约各占一半。颠换多发生于c和a之间.

并几乎都集中在hvi。人群中点异质性的发生率因检

测方法的灵敏度不同而差异很大。hvi 16 189nt碱基

替换的发生率很高,其中t—c转换高达l5%。

长度异质性主要发生于hvi 16184 16193 nt

和hvii 303—315 nt的c—stretch区,表现为c数目

的差异。在序列测定时可观察到16 189 nt和310 nt

后多个信号峰交叠形成的模糊序列,即“手指样结

构”。[71根据anderson序列,c—stretch分别于16 189 nt

和310nt被t阻断,可能由于复制滑动引起的相同碱

基单调连续趋势,该区被认为是突变的热点 而这一

趋势产生了长度异质性。bendall等[8】也认为长度异质

性形成原因主要是dna 复制滑动。无关个体问

mtdna长度异 质性差异较大,根据hvii 303 309

nt碱基c数目的多少,可分为单纯同质性(c7)、轻度

异质性(c8为主)、明显异质性(c8和c9为主)和t—c

转换后序列失控(c10一c14)4种。hvi 16 189nt约

l5%的t—c转换中又有66%形成长度异质性。[91与

hvi不同,hvii的t很少缺失。由此认为hvii的长度

异质性机制是c在303—309 nt区域内的插入和复制

滑动,形成3lont p c的转换。同一母系中,与16 189

· l4l ·

突变相关的长度异质性,分布和变化相对稳定,但无

关个体问差异很大。bini等[1ol研究发现异质性长度c

的个数与c—stretch上游的a碱基数目呈负相关,相

对于c数目的不稳定性,同一个体a数目恒定,这一

发现对家系分析和法医学领域中包括单根毛发在内

的组织比较有较大意义。一般而言,如果c—stetch区

的c多于8个,就会增加长度异质性的几率。⋯1

通常.骨骼肌和神经组织的异质性水平相似,毛

发中相对较高.外周血的异质性最低。[121

三、mtdna异质性检测方法

(一)测序

序列测定是检测mtdna多态性和异质性最常用

的方法。尽管一直以来测序被认为是检测突变的金标

准,但若异质性水平低于20%该方法即很难检出,这

也是先前普遍认为异质性发生率很低的原因。克隆后

测序又比pcr产物直接测序更可靠,因其可排除因

pcr过程中taq dna聚合酶滑脱造成的序列改变。

对hvii轻链测序发现,由于临近c—stretch区产生的

长度异质性使3lont的异质性比率达50%,这是一种

普通的人为假象,通过对重链的测序可消除该假象。[131

因此为避免可能存在的影响,mtdna高变区序列测定

要求对重链和轻链进行双向测序,并至少重复一次。

(二)序列特异性寡核苷酸(aso)探针杂交

pcr—aso分析技术先用pcr扩增得到靶dna

片段,再用aso探针与目的dna扩增片段杂交.阳性

结果说明靶dna含有与探针相应的等位基因。尽管

pcr—aso分析技术有操作简单、灵敏度高、特异性好

等优点,但目前所用特异性探针较少,系统的个人识

别能力有限是其局限性之一。多重pcr特异性寡核苷

酸片段用于检测突变链,可以发现小于l%的异质性,

然而等位特异性扩增很容易受pcr初始熔链温度的

影响,易发生错误的扩增,且无法估计异质性的数量。

(三)限制性片段长度多态性(restriction 哪ent

length polymorphism,rflp)分析

在mtdna高变区,大约有2/3的碱基变异涉及限

制酶识别位点,故可用rflp检测点异质性。与直接测

序相比,荧光rflp分析较低程度的异质性更灵敏一

些。但应注意避免因不完全消化而导致错误的结论。

(四)单链构象多态性(single strand conformation

polymorphism,sscp)分析

pcr—sscp技术可灵敏地检测到单一碱基的突

变,且具有操作简单、快速、成本低、灵敏度高、无假阳

性等特点,适用于大样本dna突变的筛查。但存在影

响因素较多、条件不易掌握及带型难以解释等问题。

· 142 ·

基于毛细管电泳技术发展起来的荧光sscp(f—sscp)

技术,其灵敏度非常高,特异性好,但技术要求及成本

均很高。

(五)变性梯度凝胶电泳(denaturing gradient gel

electrophoresis,dgge)

dgge是基于待测dna片段双螺旋的解链温度

(tm)来进行突变检测的,它具有灵敏度高、分离片段

可回收测序、一次可检测大量样本等优势。1999年,

steighner等㈣在评估pcr—dgge技术检测mtdna

hv1序列多态性的可靠性时。所有设计的49对配对

序列(每对仅存在1bp差异)用该技术可全部有效加

以区分。pcr—dgge技术检测异质性的灵敏度高达

l% ,远远高于序列测定。但该技术存在实验之初需进

行计算机分析或预试验以确定最佳的分离条件、需使

用带gc—clamp的引物增加了实验费用、gc含量较高

的片段不易分析、制备精确的梯度凝胶需要熟练的操

作技巧及复杂的仪器设备、仅能检测突变的存在不能

确定突变的类型等不足

(六)变性高效液相色谱(denaturing high—performance

liquid chromatography,dhplc)技术

dhplc是一种可自动检测单碱基替代及小片段

核苷酸插入或缺失的一种高性价比分离技术.具有自

动化、快速、经济、检出率高、检出dna片段大小范围

广、既可分析已知突变也能筛查未知变异等优点.成

为目前分析已知或未知基因突变及单核苷酸多态性

的最佳技术平台。目前只有f—sscp技术在敏感性和

特异性方面能与dhplc相媲美。其不足是不能检测

纯合突变(要检测纯合变异一定要预混等量的野生型

样品以产生异源杂合双链),只能提示突变的存在.无

法确定具体的错配类型及位置,尚需测序进一步确

定;许多片段有多个主要解链温度.需要筛查的温度

点较多,增加了工作量。

dhplc可直接通过异源双链的形成来检测异质

性的存在。如有必要,还可根据保留时间的差异将不

同的片段各自收集后测序

(七)其他检测方法

融解曲线分析、基质辅助激光吸附电离飞行时间

质谱(matrix assisted laser desorption lonization time

of flight mass spectrometry,maldy—tof—ms).dna

芯片(dna chip)等技术,都可以用于mtdna异质性

的检测

四、mtdna异质性的法医学应用及展望

mtdna因其母系遗传特征、进化速率快、拷贝数

多等特点,使其在法医学鉴定中,尤其是对毛干、指甲

法律与医学杂志20__年第13卷(第2期)

等无核生物检材或核dna分型失败的样本具有特殊

的应用价值。一方面,由于mtdna异质性的存在,使

其在进行常规个体识别和亲子鉴定等应用时使鉴定

结果产生不确定性;另一方面,mtdna异质性又可作

为个体的特殊标记,增加个体的认定或排除的确定

性。

法医个体识别鉴定中第一次遇到异质性问题是

末代沙皇尼古拉二世的遗骸鉴定案。l15】此后,mtdna

异质性问题逐渐引起法医学界的重视。早期研究认

为.mtdna的异质性在正常人群中很少见,可能与当

时的检测技术缺乏敏感性有关。随着相关技术的发

展.越来越多的文献报道在非编码区检出异质性,并

且以一定的频率存在于正常人群中。2o0o年,tully等

用dgge技术对253个随机个体血样的mtdna

hv1进行了分析.发现35个个体(13.8%)存在异质

性.其中33个为单核苷酸异质.2个为二核苷酸异质,

这些异质性共涉及16个不同的核苷酸.进一步证实

了mtdna异质性存在的普遍性。salas等 (20o1)报

告1例案的头发.在同一根被害人头发的2个不

同部位取材.竟 然发现序列有差异.一个结果是16 093

t.16 189t:另一个结果是16093c/t.16 189c/t 由于

序列测定检测mtdna异质性灵敏度较低. 因而

mtdna异质性的出现对测序这种在法医学实践中应

用最广泛的mtdna鉴定手段是一种挑战

当比对两份mtdna的序列时.若dna序列相同

则表明这两份检材有可能来自同一个人或同一个母

系亲属,尤其是它们之间还具有相同的异质性时.这

种概率更大。国际法医遗传学会规定.在遇到两个样

本出现一个碱基不同,而且这个碱基位置被公认为是

异质性热点,则不能排除:当遇到两个碱基位置不同

时,如果两个位置都是异质性热点,则不能排除.否则

为不能判断。当出现3个位置的不同时.目前还没有

群体数据显示同一个体异质性同时在3个位置出现

的情况,在排除污染、细胞核假基因扩增产物的情况

下,并按照国际法医遗传学会mtdna标准操作方法

执行的,可以做出排除结论。为避免错排.尤其是比较

来自毛发mtdna样品时,建议尽可能多的分析样品.

需要再取其他的材料如多根头发、唾液或血样进行复

查,以减少因异质性存在而被错排的可能性.如果多

份检材的异质性出现在同一位置的同一碱基处.反而

对认定同一个体检材有利

mtdna的异质性发生机制及在人群中、个体内不

同组织中的发生频率究竟有多高. 目前还未明了.有

待于进一步研究。由于异质性的存在.对于个体识别

法律与医学杂志20__年第l3卷(第2期)

的鉴定,必须正确评估mtdna在法医常规检案工作

的重要性。因此,要对样本做出相应准确可靠的判断,

首先要了解群体中异质性的分布情况.熟悉各种异质

性出现的概率和相应位置。这就要求对群体进行异质

性调查,建立相应的异质性数据库,从而为线粒体

dna在法医学上的应用提供有效保证。异质性的检出

在很大程度上依赖检测方法的灵敏度.但目前尚未有

标准化的方法来检测mtdna异质性.需要开发一种

标准化的检测方法作为金标准。

参考文献

[1] lutz s,weisser hj,heizmann j,et a1.a third hypervariable region

in the human mitochondrial d-loop【j].hum genet,1997,101:384

[2] lutz s,weisser hj,heizmann j,et a1.mitochondrial heteroplasmy

among maternally related individuals[j].int j legal med,1999,1 13:

155~161

[3] hauswirth ww, laipis pj.mitochondrial dna polymorphism in a

maternal lineage of holstein cows 【j]. proc natl acad sci u s a,

1982,79(15):4686-4690

f4] ashley mv,laipis pj,hauswirth ww.rapid segregation of hetero—

plasmic bovine mitochondria【j].nucleic acids res,1989,17:7325~

7330

[5] bendall ke,macaulay va,baker jr,et a1.heteroplasmic point mu—

tations in the human mtdna control region [j]. am j hum genet,

1996,59(6):1276~1287

【6] gill p,ivanov pl,klimton c,et a1.identification of the remains of

the romanov family by dna analysis[j].nature genet,1994,6(2):

130~135

【7] htihne j,pfeiffer h,brinkmann b.heteroplasmic substitutions in the

mitochondrial dna control region in mother and child samples [j1.

int j le gal med[:请记住我站域名/],1998,112:27~30

【8] bendall ke,sykes bc.length heteroplasmy in the first hypervariable

· 143 ·

segment of the human mtdna control region,am j hum genet,1995;

57:248~256

[9] bini c,ceccardi s,luiselli d,et a1.different informativeness of the

three hypervariable mitochondrial dna regions in the population of

bologna(italy)fj].forensic sci int,20__,1 35:48-52

【lo] malik s,sudoyo h,pramoonjago p,e1.a1.nuclear mitochondrial in—

terplay in the modulation of the homopolymeric tract length hetero—

plasmy in the control(d-loop)region of the mitochondrial dna 【j].

ham genet,20__,1 10:402-4 1 1

[1 1] lee hy,chung u,yoo je,et a1.quantitative and qualitative profil—

ing of mitochondrial dna length heteroplasmy【j].electrophoresis,

20__,25:28~34

[12] takayanagi k,asamura h,tsukada k,et a1.investigation of mtdna

heteroplasmy discordance between mother and child[j1.int congress

series.20__.1261:380-382

[13] lutz-bonengel s,sanger t,pollak s et a1.diferent methods to de—

term ine length heteroplasmy within the mitochondrial control region

[j].int j legal med,20__,118:274-281

[14] takahashi n,hiyam a k,kodaim m,et a1.the length polymorphism

in the 5 flanking region of the human beta—globin gene with de—

naturing gradient gel electrophoresis in a japanese population [j1.

hum genet,1991,87(2):219~220

[15] 郭景元,李伯龄. 中国刑事科学技术大全法医物证学[m].第1版.

北京:中国人民公安大学出版社.20__. 490

[16] tully la,parsons tj,steighner pd,et a1.a sensitive denaturing

gradient-gel electrophoresis assay reveals a high frequency of het—

eroplasmy in hypervariable region 1 of the human mtdna control re一

西0n[j].am j hum genet,20__,67(2):432-443

【17】salas a,lareu mv,carracedo a.heterplasmy in mtdna and the

weight of evidence in forensic mtdna analysis:a case report fj].int

j legal med,20__,__:186-190

(收稿:20__—1 1—22;修回:20__—03—02)

、! |、

(上接第s4页)

良后果承担完全责任。建议我国借鉴美国的相关规定

来立法。

4.智能障碍(痴呆)和遗忘综合征:这类吸毒者的

脑病理改变程度相当严重,恢复正常的可能性不大,

即使评定有刑事责任能力,也无受审能力和服刑能

力,为节省办案成本和发扬人道主义精神,建议对他

们评定为部分或者无刑事责任能力。

5.残留性或迟发性精神障碍

其中的痴呆和遗忘综合征按“智能障碍(痴呆)和

遗忘综合征”处理,其他的均评定为有刑事责任能力。

为缩减控制吸毒人数,有法学人士主张我国刑法

应规定吸毒为犯罪行为。事实上,吸毒人群的确是犯

罪的高危人群,吸毒者成瘾后一般都有人格改变,变

得缺乏责任心、喜欢说谎、自制力差和懒散等,加上作

为下临床诊断的主要症状之一,也就是意识障碍,它

不同于别的精神症状.即医生鉴定时往往不能当场直

接发现该症状,确定有无意识障碍主要依靠警方收集

的材料和被鉴定人案发后的积极配合,能指望爱说谎

的吸毒者积极配合查证吗?有鉴于此,鉴定医生诊断其

精神障碍的准确性和法庭对部分刑事责任能力结论的

采信度不无疑问。所以,笔者仍继续主张对精神异常的

吸毒者犯罪一般以完全刑事责任能力评定为最优。如

果吸毒诱发了自身原有的精神病,且本人对作案行为

丧失或减弱辨认或者控制能力,则评定为部分刑事责

任能力。不评定无刑事责任能力是因为吸毒本身为法

律所禁止,行为人未尽戒毒义务有一定的主观过错,对

这部分过错本人应该承担相应的法律责任。

上一篇:静滴莪术油注射液过敏致死的法医学鉴定(附2例... 下一篇:谈作文教学的四维辅导